小琉球因為特殊的天然資源，吸引100多隻的保育類綠蠵龜在淺岸定居，當地潛水業者也常帶遊客下水欣賞綠蠵龜奇景，但最近林務局接獲檢舉，有潛水業者縱容遊客追逐海龜，甚至是拉扯海龜尾巴，夜間還用強光直射海龜攝影，讓綠蠵龜飽受騷擾，不過被指控的業者是否認再三，而林務局保育科則表示，一旦查證屬實有可能會被處1年以下有期徒刑，或者是併科6萬到30萬元以下的罰金。
用手抓住綠蠵龜尾巴，讓大海龜想遊都遊不走，這是遊客到小琉球潛水時的照片，如此騷擾驚嚇海龜的行徑PO在網路上被人檢舉。
甚至還有潛水客在夜間用強光直接照射綠蠵龜，明顯騷擾綠蠵龜的行徑，囂張的PO在臉書上，甚至是近距離包圍海龜合照，追逐海龜。遭指控潛水業者：「我們一定不會去做這樣的事情，因為我們每一個都是海洋志工啊。」
被指控縱容遊客騷擾海龜的業者表示不可能有這些行為，但事實跟證據擺在眼前，其實小琉球當地潛水看海龜的活動很夯，但大家都有共通的原則比須遵守，那就是不能騷擾、追逐、餵食，也要保持安靜，以海龜不受驚嚇為準則，
林務局保育科長林國彰：「是有一個屏東小琉球當地的協會，這2天有跟我們講起這個事情，我們會請縣政府協助來宣導這樣的一個理念。」
林務局保育科表示，最近的確有接獲民眾檢舉潛水業者帶遊客下水時騷擾海龜，一旦查證屬實，業者跟遊客將依照野生動物保育法開罰，獨特的綠蠵龜奇景帶動小琉球觀光業，如今珍貴資源成了業者的搖錢樹，若不好好珍惜，恐怕會影響綠蠵龜的生存空間。
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