520的重頭戲，陳水扁總統跟呂秀蓮副總統上午在文武百官以及中外觀禮貴賓面前，宣誓就職，並且立刻簽署公文，任命新內閣。
大雨之中，陳水扁總統以及副總統呂秀蓮抵達就職典禮會場。呂副總統一身粉藍色套裝，和第一夫人吳淑珍的粉紅褲裝顯得格外搶眼，在全場20萬國內外來賓的見證之下，宣誓就職。總統陳水扁：「總統誓辭，在全體國人的見證之下，本人以最莊嚴及虔敬的心情在此鄭重宣示將遵守憲法及法律規定，公正無私執行總統職務，並竭盡所能促進族群和諧與全民團結，追求公平正義，捍衛國家主權及尊嚴，決不辜負國人付託，謹誓，宣誓人陳水扁。」
副總統呂秀蓮：「副總統誓詞，在全體國人的見證之下，本人以最莊嚴及虔敬的心情在此鄭重宣誓將遵守憲法與法律規定，公正無私執行副總統職務，並竭盡所能輔佐總統，促進族群和諧與全民團結，追求公平正義，捍衛國家主權及尊嚴，決不辜負國人同胞的付託，謹誓，宣誓人呂秀蓮。」
在掌聲中陳總統、呂副總統正式就任中華民國第11任正副總統，而陳總統也隨即簽下他連任之後的第一份公文，任命新內閣。
儀式結束，友邦使節一一握手祝賀，第11任正副總統和新內閣，這一刻起，正式上路。
