國民黨黨中央傳出有清理門戶的念頭，這個消息一出現，國民黨內幹部趕緊出面否認，還說這是綠營人士的分化伎倆，國民黨發言人郭素春說，連戰曾經約見過所有的本土派立委，他們都拍胸脯保證會繼續待在國民黨，所以不會有所謂「清黨」的問題！
連宋敗選後，國民黨的本土派不斷提出改革方向，不過因為和黨內部份高層有不同意見，甚至還被批評是軟腳蝦，如今傳出國民黨將清理門戶，鎖定的目標更指向與綠營密集接觸的異議人士，這項消息黨中央及黨團鄭重否認。
國民黨文傳會副主委郭素春：「這又是一個分化，一個見縫插針的人士，他們所搞的，陳宏昌，陳委員多次有不同意見表達，但是那天呢！一個主席大庭，他們說，主席你放心，我永遠不會離開國民黨，所以我們對所有的黨員同志，這些立法委員、連戰主席都有信心。」
與李前總統交情不淺的國民黨本土派立委張昌財，坦承台聯也曾經多次徵詢入黨，但張昌財都拒絕。立委張昌財(國)：「一直都在黨裡面當烏鴉，跟綠營親近機會實在太少了，所以可能性不太啦！」
另外還傳出在林豐正去職後，國民黨將讓黨外人士擔任秘書長，馬英九聽到這樣的消息，直說不可能。台北市長馬英九：「因為我們秘書長一樣是黨員啊！怎麼可能找黨外人士呢！我覺得這個是沒有常識的看法啦！」
據了解，國民黨內部直指這是台聯為了吸納國民黨人士的分化技倆，但在還沒證據之前，國民黨先出面澄清，阻絕流言加速黨內同志出走。
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