中央政府總預算遭到立法院大砍，行政院除了表達遺憾，行政院長游錫堃還強調，他實在不明白為什麼行政院組織法沒有辦法過關。
行政院發言人陳其邁：「對於審議的結果，尤其是這些法案，特別是行政院組織法跟勞動三法，我們行政院表示高度的遺憾。20萬公務員的績餉全部刪除，這個部分對於整個政務的推動、對公務人員的士氣是一項嚴重的打擊，恐怕會造成齊頭式的平等跟不公平的競爭。
對於大法官加給的部分，在這一次是全數遭到刪除，那我們認為這個是明顯的政治報復，這個部分我想任何透過政治利益來要影響司法獨立的作法，我們都認為是不恰當的。」
除了總預算案歷經波折外，立法院這個會期只通過了56個法案，創下歷屆新低，包括行政院組織法、族群平等法和勞動三法等重要法案都沒有過關，基於立院屆期不連續的原則下，一切都將重頭來過。
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