聯電案使得長期以來高科技廠商課不到稅的問題再度受到關注，行政院長謝長廷指示財政部，應該要研究「最低稅負制」。財政部長林全也承認，促進產業升級條例每年讓台灣損失500億的稅收，但是竹科產業公會馬上跳出來反擊，他們認為課太重的稅，將使得台灣的高科技沒有競爭力。
這是台積電尾牙花千萬請明星勁歌熱舞的畫面，這是鴻海尾牙抽出頭獎300張股票的場子，這些高科技產業公司每年賺很多錢，卻不用繳太多的稅，行政院長謝長廷認為不公平。行政院長謝長廷：「最低稅負制是財政部本來在構想，現在正在構想中。」
至於要不要採取最低稅負制，讓高科技多繳稅，財政部長林全沒有證實，但他也承認產業優惠條例，讓政府每年流失500億的稅。財政部長林全：「以最新的資料來看，（優惠條例損失的稅收有500億左右）確實有些科技產業有相當一段時間，繳稅紀錄非常低，甚至是零。」
對於這些高科技業者賺錢卻不用繳稅的質疑，竹科方面有話要說。
要多課稅，竹科強力反擊，複雜的稅制利益問題，正考驗謝內閣的協調能力。
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