行政院推動三合一選舉，引爆蘇貞昌和謝長廷不同調風波，儘管行政院表示，是在執行陳總統政策，但是黨政高層卻透露，陳總統並沒有要求趕在今年底就要實施，而根據本台掌握的獨家消息，總統最近私下抱怨，他以為會是蘇貞昌衝過頭，沒想到卻是謝長廷。
這次府院高層會晤，三合一選舉引爆黨政不同步糾紛，預料會是扁謝會討論的重點。
雖然行政院一再強調，推動三合一選舉，是在執行陳總統的理念，不過與陳總統互動密切的民進黨大老柯建銘，卻出面提醒。
柯建銘說大白話，透露陳總統是支持選務單純化的精神，但是並沒有明確訂出時間表，而根據了解，陳總統最近很在意有人衝過頭。
民進黨主席交接典禮上，陳總統才提醒蘇貞昌不要太衝，不過根據TVBS掌握的消息，總統曾經向核心幕僚透露以為會是蘇貞昌衝過頭，沒想到卻是謝長廷。
而根據了解，謝長廷上任前就明確宣示暫緩正名，制憲對抗大陸反分裂法，以及江丙坤赴大陸府院不同調，一直到這次三合一選舉，一連串舉動，都讓總統府頗有微辭，謝內閣上任兩個月，府院關係繼續處在磨和觀察期。
