原定15號啟用的花蓮機場航站新廈，因為部分圖說和文件證明不足，因此沒有取得花蓮縣政府核發使用執照，還一度引發中央和地方的爭議，經過近一個星期的補証，花蓮縣政府已核發使用執照。
花蓮航站新廈，因為在圖書文件不完備情形下，申請執照，而且過縣政府兩次派員會勘，發現導盲設施和設計圖上沒有標示商家，卻無故多出三間商店等47項缺失，因此並未取得使用執照。
國工局人員連夜趕工修正，補齊證明文件，終於在年節前取得執照，不過這段期間正好遇上春節連假，旅客運輸尖峰，新舊航廈來不及交接轉換，暫時仍以舊廈維持運作，因此最快得等到年假結束後一個星期，新廈才會正式啟用。
