總統大選辯論的第二場，在下午舉行。連戰一開始就先抨擊對手，施政不力，只會抹紅、抹黑他，在外交關係及兩岸問題上毫無建樹。不過陳總統則說，自己的個性是不怕困難、永不放棄，連戰沒有主張，是個乖乖牌，遇到困難就退縮。
針對男女平權問題，陳水扁批評連戰，沒有選擇女性作為副總統候選人，連戰則說，他如果執政，將盡力保障1/3婦女參政名額。
在經濟產業問題方面，連戰認為，目前台灣最需要「增加附加價值」，陳總統則強調，台灣是亞洲中心，同時，台灣主體性也必須重視。
連戰提問，國家考試題目用閩南語發問，對族群之間的關係是一種傷害，他希望陳總統一起推動國內第一部族群平等法，操弄族群應該受到譴責；陳水扁則回應，國家考試題目有閩南語，這件事並非行政院或是總統的意思，考試院也已經認為不妥，未來絕對不會再發生類似事件，打壓語言是過去國民黨的事情，他也將推動語言平等法。
針對總統夫人吳淑珍買賣股票一事，陳水扁認為並不適宜，但絕無不法，他也向全國民眾表示歉意；不過他也抨擊連戰，把財產移到國外，這才是隱匿財產，偷偷摸摸。
陳水扁說，辜振甫告訴他，根本沒有92共識，連戰一直主張一個中國，還說兩岸要組成邦聯，可是國際上知道的一個中國，是中華人民共和國；連戰則反駁，他並未公開發表兩岸要組成邦聯的意見，中華民國就是那一個中國，這也是陳水扁宣誓就職總統時所效忠的國家。
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