台藝大申請應用媒體藝術研究所博士班，被教育部駁回，其中一個理由是，曾經有意頒發榮譽學位給吳宗憲，校方相當低調，倒是學生非常不服氣，站出來為學校抱屈。
有教育部長杜正勝署名的公文，其中上頭第七項，內容是近日報紙報導台藝大將授予藝人吳宗憲榮譽學士學位，報紙報導不一定可信，但如果學校將授予藝人吳宗憲榮譽學士學位，反應出學校對於授予學位的態度，無法謹慎看待與管控。
高教司長陳德華：「學校本身是一個社會的公器，學位本身的頒授更是一個社會的公器，這種社會的公器的一個使用，我覺得必須要有一個更嚴謹的思考跟評估。」
台藝大主秘謝文啟：「我們會努力按照委員的意見，可以做的部分我們會去改善，跟博士班申設無關的事情，我們學校不會特別去有什麼特別的回應。」
學校態度低調，不願意把兩件事混為一談，強調申請博士班沒過，會檢討師資以及資源不足的問題，倒是台藝大學生很有意見。
台藝大學生：「不要因為吳宗憲的事情，抹殺掉我們學生的權益還有學校的形象。」
台藝大學生：「這個其實不能因為說吳宗憲一人，這兩個根本是完全兩碼子的事情。」
學生實在難以接受，讀博士班的升學權益，竟然會因為「吳宗憲」被剝奪。
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