一名從柬埔寨返國、完成14天檢疫後，自主健康管理期間出現症狀採檢確診，檢驗Ct值為12、病毒量高的台籍女子（案16859），經疫調擴大篩檢，後續又揪出從美國返台的男子也確診（案16870），由於2人都曾入住台北市中正區同一家防疫旅館，重疊時間有6天，且2人房間相鄰，指揮中心將比對兩人的病毒基因定序，釐清是否有交互感染。但值得注意的是，案16870發病時間更早卻未通報，台北市長柯文哲今（16）日受訪時認了防疫SOP有問題，有症狀就應立即篩檢，並下令修改，所有防疫旅館人員造冊、要打第3劑，同時旅館也都發給快篩劑，有症狀就要篩。
針對案16870為何在12月6日當天出現不適症狀卻沒有篩檢？台北市副市長黃珊珊15日解釋，該案在12月5日時從美國返台，當時採檢為陰性，但在12月6日時曾出現不舒服狀況，甚至有發燒情形，當時安排通訊診療方式並用藥緩解，由於才經過一天，所以研判免篩，直到案16859確診後，12月14日擴大採檢案16870才被抓出染疫，其Ct值31，已經無症狀。
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後續有專家質疑有症狀就應該立即篩檢，質疑北市府防疫SOP是否出問題？對此，柯文哲受訪表示，自己也同意這個說法，認為上呼吸道有症狀就應該要篩檢，因此他昨天已下令更改SOP。
柯文哲認為，「現階段防疫旅館比醫院還危險」，因為每天入境大概十幾個確診，反而在國內醫院裡沒有，因此標準要升級到跟醫院一樣，會針對防疫旅館人員造冊、全部要打第3劑。
柯文哲指出，此次確診的2人住在隔壁，經追查確認沒有晚上跑出來聊天，至於是透過工作人員感染還是透過通風系統，會找公衛專家檢查通風系統，進一步釐清；而現在所有防疫旅館都已發了快篩劑，一有症狀就先做篩檢。
至於防疫旅館其他人員的檢測結果，以及是否較可能是在防疫旅館感染等問題，柯文哲表示，同團進來那一批人全部一人一間隔離，送到中央檢疫所。這段時間內，每隔一段時間會做PCR篩檢，有時無症狀帶原者就約40%，所以要監視。
柯文哲也呼籲還沒打疫苗的民眾盡快去施打，「因為百密一疏，再怎麼守不小心就會破口，實驗室外洩、旅館外洩，我也不認為台灣可以永遠鎖國下去，終究還是打疫苗才是最後解決辦法」。
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