中央疫情指揮中心才剛同意離島設置快篩站，不過現在澎湖縣政府獲得議會及當地立委同意，將從六月一日起，要求乘客強制快篩，否則隔離14天，而金門縣府則表示，將要求中央於目前有飛金門的台灣機場端，包括松山、台中、高雄設置快篩站並強制快篩。如果沒有設置，就要同意在金門機場針對入金門人員全面強制快篩，對此指揮中心低調的說，會再派人了解了解。
記者vs.乘客：「怎麼不篩檢這樣子，因為都在家裡呀。」
記者vs.乘客：「快篩出來的結果是什麼，陰性，陰性嗎，對，那比較放心了嗎，對對對，因為有在出差這樣。」
明明有不少人覺得機場快篩站立意良善，但根據統計，從28日設置到29日中午，545名入境乘客，只有265人自願快篩，比率不到五成，逼得澎湖縣政府難得跟議會以及當地立委口徑一致，決定要在六月份起使出強制手段。
澎湖縣政府發言人陳其育：「不同意全面快篩的話，我們決定從六月一日開始，拒絕快篩的民眾，我們會強制集中檢疫14天。」
金門縣長楊鎮浯：「我想這是一個我們離島，非常嚴正對CDC的要求。」
其實日前金門就曾在機場設置快篩站，要求入境乘客強制快篩，不過短短一天就遭到拆除，直到中央做出可自願不得強迫的決議，才讓離島同意設置快篩站，但短短兩天就因為成效不佳，地方政府要擅自變更遊戲規則，也讓中央很緊張。
流行疫情指揮中心副指揮官莊人祥：「目前只有看到它(澎湖縣府)附文過來而已(沒計畫書)，我們還是要依照傳染病防治法第17條第一項，由指揮官依法來同步協調政府機關。」
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