華航案目前已衍生20例確診，擴及機師、機師家屬和諾富特員工，就連總統蔡英文也在臉書發文，表示「出現零星本土案例不可怕，但過度輕忽恐造成防疫破口擴大。」呼籲國人要更謹慎小心，今天(5/2)一早國軍化學兵和清潔隊也進到華航園區，進行大規模清消防堵病毒擴散，明天(5/3)起，指揮中心也將對全台防疫旅館總體檢，感染科醫師就呼籲，尤其是外籍機師喜歡去的健身房和餐廳，這2處清消要特別加強。
陸軍第六軍團三三化學兵群上校指揮官龔龍峰：「使用1000ppm的濃度，接著靜置20至30分鐘左右，進到室內後由上而下，請華航公司將空調全部都打開，讓氣霧跟消毒藥劑可以瀰漫整個室內。」
30化學兵由上而下清消，使用1:1000漂白水，開著冷氣空調加速消毒劑散播病毒。
出動車載式噴霧機，園區繞行噴灑消毒，國軍化學兵和清潔隊，加起來約50人採內外夾擊。
桃園環保局環境清潔警察大隊長羅文林：「室外比較大範圍的面積，跟地下室的部分，清潔大隊我們是出動我們的車機，行消毒的作業，可以節省相關的人力。」
記者吳軒彤：「華航園區大規模消毒，分為清潔隊還有國軍化學兵，化學兵等到在裡面清消完畢，(出來後)會來到這邊做全身清消，預計整個流程會在3小時內完成。」
華航加強消毒頻率，為了防止再次引爆感染，陳時中也一聲令下，3日起展開全台防疫旅館總體檢，尤其外籍航空機組員，入住的防疫旅館更須加倍警覺。
感染科醫師黃高彬強調，像是旅館房間地板和窗簾，應選用光滑材質，漂白水消毒才會比較，容易將病毒擦拭，另外常碰觸的門把，和外籍機師常去健身房餐廳，更要加強清消。
目前諾富特群聚累計4例，還不確定誰傳誰，但指揮中心研判非空調傳染。
除了要透過環境採檢，追查感染源，照病毒相同序列，羅一鈞也說不排除人際間傳播，恐怕是在房務進出整理，或送餐需求時染疫，專家表示未來房務，要改掉用手觸摸檢察習慣，才能有效遏止病毒擴散。
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