很多人打不到公費疫苗，乾脆改打自費流感疫苗，目前有4家廠商，其中國光是台廠，供貨最多，進口的東洋價格最高要1500元，有專家建議，如果想避免感染肺炎重症，可以改打肺炎鏈球菌疫苗，保護力最高可達10年，但價格比起流感疫苗貴，價格大約3000到3500元。
自費疫苗總共有115萬劑，特別是現在，50到64歲，暫緩施打，很多長者小孩，乾脆多花錢，到醫院診所轉打自費疫苗，總共有4家廠商，醫生說防護效果是一樣的，其中葛蘭素史克、賽諾菲跟國光，價格850至1200元，東洋因為是細胞培養疫苗，最貴要1500元，國光是台廠，貨量是裡面最多的。
心臟內科醫師林謂文：「大概比以往多1至2成左右，的確有這樣(增加施打)的狀況，自費疫苗可能是國外廠商，民眾想選擇比較好的疫苗做施打，其實國光跟自費(進口)的疫苗，效果其實都是差不多的。」
擔心秋冬，流感跟新冠肺炎，雙重夾擊，因此醫生認為，如果是有打流感疫苗的人，當出現呼吸道症狀、或疑似感染新冠肺炎，就能優先排除，得到流感的可能，直接做新冠肺炎篩檢，減少對病患的折騰，甚至台大兒醫主治醫師李秉穎呼籲，如果想靠疫苗預防肺炎重症，打肺炎鏈球菌的效果，比流感疫苗好。
心臟內科醫師林謂文：「大概每家價格差不多，坐落在三千多元左右，可是肺炎鏈球菌疫苗，是13價的肺炎鏈球菌疫苗，它的保護效果是比較長的。」
肺炎鏈球菌疫苗，公費必須75歲以上才能施打，部分縣市65歲就能施打，公費有分23價跟13價，除了菌種數量，保護力時效也不同，一個五年跟10年，但取消了50至64歲的流感公費疫苗，建議改打肺炎鏈球菌，對這群人來說多花錢，得多花一筆錢。
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