準教育部長吳茂昆接二連三遭到爆料，先是跟同樣念物理的兒子吳孟真共同掛名高達13篇論文，前總統府秘書長羅智強還PO出照片，指他曾在大陸軍方色彩濃厚的公司當技術顧問，打臉吳茂昆的莫須有說。
國民黨發現，吳茂昆的兒子吳孟真從2007年到2014年，有13篇論文全跟父親一同掛名，其中2009年到2010年最密集，12篇就有8篇論文出現父親「吳茂昆」。
國民黨副發言人洪孟楷：「父子的關係有可能在進入中研院這邊，也有讓人家一些詬病的講法。」
國民黨質疑，吳茂昆一切都是為了要讓同樣學物理的兒子進中研院，學界教授也直言，父子掛名雖不違法，但這狀況在物理界很少見。
坐在前排正中央的是準教育部長吳茂昆，跟一群大陸學者專家合影，其中一位還是大陸西北研究院的周廉，這張2016年的照片被翻出來，打臉吳茂昆。
前總統府秘書長羅智強：「周廉長達2004到2010年，至少6年的時間把你列為技術顧問，難道周廉你的好朋友都沒有告訴你嗎？」
羅智強踢爆更進一步踢爆指，吳茂昆在2004年擔任國科會主委時，不但擔任對岸技術顧問，任職西部超導的母公司，還是大陸軍用稀有金屬科研的生產基地，軍方背景濃厚。
儘管吳茂昆以莫須有3個字否認，政院發言人徐國勇也說2016年那張照片是移花接木，是吳茂昆參與上海研討會的照片，但似乎無法說服大眾，而國民黨現在也以違反兩岸人民關係條例及國家機密保護法告發吳茂昆，其相關爭議越滾越大，中央從行政院到陸委會急著幫忙澄清，對照對管中閔的高標準、高檢視，落差似乎很大。
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