行政院長賴清德過去曾經在立法院跟當時的閣揆吳敦義針鋒相對，但其實賴清德後來擔任台南市長時，主張刪掉議員的小型工程補助款，在當時也獲得吳敦義的支持，吳敦義說自己向來也是這樣貫徹，所以賴清德當年出席行政院會談到這件事，吳敦義也都公開力挺。
時任立委賴清德：「我沒有請財政部長回答，他怎麼可以這樣子，下去好嗎，請你下去。」
咄咄逼人不留餘地，7年前還是立委的賴清德質詢閣揆吳敦義，儘管2人針鋒相對，但在賴清德擔任台南市長時，主張刪掉議員的小型工程補助款，當時吳敦義可是舉雙手贊成。
國民黨主席吳敦義：「我不是贊同，我一向都是這樣子貫徹，我36年前做南投縣長、28年前做高雄市長就是這樣子，維持這個原則。」
直說那是自己一貫的立場，不是支持，但當年賴清德因為要刪工程補助款，跟議會鬧成僵局，出席行政院會，吳敦義還特地跟他分享心路歷程，勉勵他。
國民黨主席吳敦義：「他每一次出席我們行政院的院會他都會有所感，有一次他也遇到這樣的一個困擾，我是公開力挺，我說小型的工程費看每個縣市的狀況，賴市長如果堅持的話我基本上我是贊同。」
從過去立委到市長到現在的賴院長，吳敦義沒有多作批評，而賴清德也收起過去給人強勢印象，一接下閣揆後親自打電話給立院各黨團，說要登門拜訪，賴清德展現身段，避免跟立委們硬碰硬，向立院釋出善意，先求有個好的開始。
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