洪仲丘案爆發後，國軍的懲處制度做了大幅度調整，最被詬病的禁閉室也改名悔過室，統一交由軍團管理。不過就怕再出現類似洪案的情勢，現在部隊開始出現幹部不敢管兵、小兵以下犯上的「後遺症」。
頂著烈毒的艷陽，無止盡訓練出操，禁閉室鬧出洪仲丘命案，成為國軍心中永遠的痛。
記者相振為：「洪案發生之後，國軍的禁閉室制度跟著調整，從當年的禁閉室改為悔過室，而且統一交由軍團來管理，而當年的禁閉室，現在已經變成荒涼一片。」
鐵絲網擋不住改革的浪潮，禁閉室廢棄成了器材庫房，過去被操到光禿的黃土地，如今雜草都快長到小腿高，全台18個禁閉室改制之後，只剩各軍團下轄總共9個「悔過室」。
國政基金會高級助理研究員揭仲：「整個悔過制度沒有那個效果，為什麼，如果我們把課表攤開來看，會發現其實在悔過室裡面，反而會比在部隊正常操課還要輕鬆。」
強調人權操練銳減，懲戒效果大打折扣，看看現行悔過內容，採行上課休息睡眠，各8小時的「三八制」，過往被嚴格執行的出操跟基本教練，現在只剩2個小時，而且明確規範「嚴禁體罰或凌虐」，改制後就算還是有數十人，被送悔過處分，但懲戒的效果大打折扣，還有軍訓役男服刑未滿15天，退伍時間到了拍拍屁股走人，直接造成幹部管教上的麻煩。
記者陸姿羽：「北五堵營區，傳出一名軍事訓練役，不服上級長官指導，竟然毆打少校中隊長。」
抗命犯上頻率增加，擔憂惹禍幹部難管，軍隊不可能看到的犯上抗命，還有下級控告上級「公然侮辱」的情事，近年卻一個接一個發生，目前士兵的懲處種類有降級記過罰薪悔過、申誡禁足罰勤罰站，有這麼多種管教的工具，但法官不懂社會不挺還怕惹禍上身，真正能夠執行的有幾項。
前軍系立委帥化民：「軍隊的定義是什麼，合法的武裝暴力集團，他學的是殺人放火，他學的是要鐵石心腸，所以他的指揮領導統御管教，都跟社會不一樣的，今天大家拿社會那套，人權自由去套在軍中，現在的中低階幹部苦不堪言。」
官難帶兵士氣難挽，長官沒辦法帶兵，更別說走上戰場，國軍迷漫的低迷士氣，可不是三軍統帥喊個幾聲就能夠恢復。
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