馬總統過境舊金山19個小時，行程超低調，只在下榻旅館與300名僑胞進行僑宴，年初過境洛杉磯，馬總統是第一個造訪洛杉磯中華會館的中華民國總統，這次卻沒有計劃到舊金山的中華總會館進行拜訪，超低調行程，難免讓人聯想跟中華總會館撤中華民國國旗有關。
TVBS特派記者倪嘉徽：「馬總統抵達舊金山的下榻旅館，當然很多僑胞熱情地迎接他，短短100公尺的距離，總統走了10分鐘才走完。」
舊金山僑胞：「馬總統，加油，馬總統、馬總統、馬總統，加油、加油、加油！」
舞龍舞獅加上總統加油的口號，北加州僑胞好熱情，馬總統下榻旅館也掛上了中華民國國旗，以及歡迎中華民國總統馬英九的紅布條，旅館高層還在門口獻花歡迎馬總統。總統馬英九：「謝謝大家，謝謝大家，謝謝，謝謝大家，謝謝、謝謝。」
由於旅館的外部大門，以及停車場在進行整修，包括馬總統在內的所有客人，都必須繞後門進來，初步規劃僑宴，馬總統進場也不讓媒體拍攝，舊金山過境之旅低調到不行。
國民黨中央委員鐘維君：「總統三次過境，都沒到中華總會館，並不是說一定要規避中華總會館，而是在以前的例子裡面，從來沒有到中華總會館，所以台北市市長的時候他去過，的確，但是其他沒有，並不是與中華總會館撤旗而不去。」
馬總統是第一位造訪洛杉磯中華會館的中華民國總統，雖然在台北市長任內，曾經訪問過舊金山的中華總會館，但撤旗事件後過境舊金山，卻沒安排到舊金山中華總會館，難免讓人多做聯想。
