原本傳出前桃園市長鄭文燦有望擔任副閣揆，前交通部長林佳龍當總統府秘書長，但現在傳出這個安排恐怕有變數，因為民進黨新任黨主席賴清德日前才喊話要「徹底解決學倫問題」，因此兩人的職務可能面臨被「互換」。另外，也有消息指出，同樣因為學倫爭議，陳明通恐怕不會留任國安局長。
民進黨新任黨主席賴清德(1/18)：「積極杜絕黑金，徹底解決學倫問題，對執政黨而言，法律只是最基本的的標準，我們必須要用，更嚴格的標準自我要求。」
鄭文燦的台大國發所碩士論文涉嫌抄襲，學倫會去年底已撤銷他的學位，現在黨內傳出，原本規畫鄭文燦接副閣揆，前交通部長林佳龍接總統府秘書長，現在傳出互換！
民進黨立委(新潮流)許智傑：「論文案的確是有爭議的點包括鄭文燦、林智堅、高虹安、許淑華，都應該都一起思考，不應該只要求中央部會首長，不要求地方首長。」
民進黨立委(正國會)陳歐珀：「佳龍部長跟我是多年的好友，我相信不論他接總統府秘書長，副閣揆或是閣揆都很適當。」
說到事涉學倫，傳國安局長陳明通不會被留任！而王國材今早陪總統視察，也被問及自己的去留！
交通部長王國材：「我想這部分就隨緣，你們所談的包括，鄭文燦市長、林右昌市長，這些都非常優秀。」
否認被總統諮詢過，只是如今政府的閣揆要交給誰，似乎傷透腦筋，換過6位行政院長的馬英九怎麼看。
前總統馬英九：「哈哈哈這個問題我不知道怎麼回答，我真的沒有發生過這個問題。」
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