近來疫苗不足，但中央在疫苗造冊施對象時，關於第二類人員不斷增加，不只藍營質疑人數一路膨脹，就連台北市長柯文哲都開砲批評「第二類是製造特權」，對此，指揮中心31日說明，中央官員造冊只有1710人、地方官員造冊2萬8794人，中央打的人沒有那麼多，但檢視地方各縣市提報的地方官員名單中，人數最多的是彰化縣、雲林縣、南投縣跟嘉義市，都是藍營執政的縣市，對此，指揮官陳時中指出，因為各縣市納入「重要官員」的標準不一才出現落差，必須要看全部的施打名單統計才準確。
陳時中指出，從公布的第二類施打人數來看，中央官員造冊只有1710人、地方官員造冊2萬8794人，其實中央官員打得不多，除非是第一線的防疫人員；不過，也因為這樣公布之後，結果又出現其他的疑問。
外界質疑，從地方官員造冊中發現，人數最多的前4個縣市，分別是彰化縣8238人、雲林縣5499人、南投縣4710人、嘉義市3842人，都是藍營執政縣市，這4個縣市所提報的人數，在第二類地方官員中，占比約77.4％；對此，陳時中進一步解釋，指揮中心每星期都會公布，各個類別的施打人數給媒體，這是從注射平台傳上來的資料，所以這會是全部施打的人員名單，而這份名單的人數會看起來各縣市有落差，這是因為一開始地方政府在造冊不完全、而且分類標準有落差，所以將要求地方政府把名單補齊全，會比較清楚。因為有些地方政府造冊時，只會將有官職的列為重要官員，但有些則是把防疫人員、或是執行檢疫人員，也就是里鄰長也放進去重要官員裡面，所以總數應該要把這三類人員都加起來，比較客觀清楚。
依據疫情流行指揮中心公布，第二類中央及地方政府防疫人員包含對象是「維持防疫體系運作之中央及地方政府重要官員」、「衛生單位第一線防疫人員」、「港埠執行邊境管制之海關檢查、證照查驗、人員檢疫及動植物檢疫、安全檢查及航空保安等第一線工作人員」、「實際執行居家檢疫與居家隔離者關懷服務工作可能接觸前開對象之第一線人員（含警察、提送餐等服務之村里長或村里幹事、垃圾清運之環保人員、心理諮商及特殊狀況親訪等人員）」、「實際執行救災、救護人員（指消防隊及民間救護車執行緊急救護技術之第一線人員）」、「第一線海巡、岸巡人員」、「實施空中救護勤務人員」及協助防疫工作之國軍人員。
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