2019年冠狀病毒疾病(COVID-19)(俗稱武漢肺炎)疫情肆虐全球，鑽石公主號郵輪今(16日)確診病例攀升至355人。駐日代表謝長廷昨(15日)晚間表示，船上的台籍乘客盼回台後，不必再隔離，引網熱議。對此，外交部今日為謝長廷說法道歉。
謝長廷昨晚在臉書PO文指出，美國16日晚間要派包機來日本將美國人載離，引發許多乘客和家屬詢問。至於台灣何時可以派包機？他指出，包機問題現正和日本交渉中。謝長廷提到，依檢疫相關規定，若19日前離開，這些乘客回到自己國內還是必須隔離，但若過了19日檢查還是陰性，那麼他們在日本可自由行動，搭乘公共運輸工具，回自己國家也沒有再隔離的道理。
謝長廷說，台灣的包機何時來載，回去還要不要隔離必須講清楚。他透露，自己和代表處同仁徹夜作業，詢問每位乘客意願，所得答案，大概是留在船上怕感染，政府可以派包機很感謝，但如過了19日，希望回台不必再隔離，同時希望低調回台，保留隱私，不希望引來太多異樣目光。PO文一出，引網友熱議，「回台當然需要隔離」、「回台請再隔離14天吧，已經被稱為海上武漢了，不該犧牲國人的安全」。不過，該文章今日已遭刪除。
對於謝長廷發言引爭議，外交部今發出新聞稿，指出謝長廷15日在臉書上發表有關處理鑽石公主號乘客的意見或問卷，和中央流行疫情指揮中心決策並不一致，外交部對所造成的混淆與困擾表示歉意。外交部強調，防疫視同作戰，我國中央流行疫情指揮中心就疫情防控是全國唯一的決策及統籌單位，外交部全力配合並尊重指揮中心的專業判斷及指揮。
對於引發爭議，謝長廷今日再發文回應，他指出，針對昨晚的臉書，網友回應很多，可見外界對此事高度關注。他認為駐日代表處的功能，就是執行國內決策，全力和日本溝通，並站在第一線保護國人的權益，反應船上國人的需求，給予慰問以及精神支持。至於接回台灣的乘客需不需要再隔離？謝長廷說，「這屬於防疫專業，如果防疫中心決定需要隔離，那就是決策，只要事先講清楚就好。再來就是執行。」
謝長廷表示，從現在開始到包機回到台灣，有很多作業必須進行，也有很多風險和困難，代表處會配合日方及防疫指揮中心妥善的完成，也會照顧好國人的隱私。
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