政府花了15億公投，但其中具有法律約束力的以核養綠，通過後政院卻說維持2025非核家園，沒有要照單全收，被外界酸說是15億的民意調查，排一兩個小時投票根本是排心酸的。許多專家也跳出來檢討公投制，希望修公民法訂定約束政府的罰則，趕在明年公投案出爐前完成修法。而賴清德接受質詢時也態度放軟，甚至脫口而出：「如果以空汙為標準，最好的能源就是核電。」
台大醫院前副院長王明鉅 :「公投結果其實是對2025非核家園政策本身投下的否決票，否決民意高達589萬票，這個票數比起2016年所有執政黨現在的立法委員總得票數538萬還多了60萬票以上。」
挾帶多數民意的以核養綠通過，實務上卻有難度。行政院的理由是，核電廠在除役期限前5到10年須提出延役申請，核一與核二廠來不及，核三廠須趕在在明年7月前，但申請的作業評估要4到5年，時間上同樣來不及。但台大醫院前副院長王明鉅就說，深澳都能一夜髪夾彎，政院說法明顯是推託。
行政院長賴清德：「公投結果政府必須尊重。」
質詢上賴清德態度放軟，但對非核家園是否轉彎還是沒有正面回應。
行政院長賴清德：「你如果要以空汙為標準，最好的能源就是，就是這個‧‧‧核電。」
從法律效力上來看以核養綠是「法律複決型」公投，主張廢除的《電業法》第95條之一，會在中選會公告的第三天起自動失效，但是除了失效，公投法沒有要求政府要負擔其他責任，行政院還是可以「本於政策」，繼續實施2025全面廢核。
律師詹豐吉：「目前我們只有仰賴其他憲政機關願意介入，比如說司法院願意介入、監察院願意介入，這樣才有效果，但這種效果就變成（公投）的命還是要仰賴政府機關的善意。」
而另外兩個能源公投，反空汙、反深澳，則是屬於「重大政策創制型」公投，通過後將「交由總統或權責機關做必要處置」，但是這個必要處置，公投法沒有說清楚，政府有很大取巧空間，專家就說，希望能夠訂出跳票罰則。
負數票協會理事長張天鷞：「行政單位在公投結束之後公然違反民意說我們不會照辦，那這個要怎麼樣去處罰。」
以核養綠發起人黃士修：「我們希望藉由公投法的修訂，在提案審查連署投票甚至通過後的法律效益，我們都希望在未來的這段時間，未來的一年內能夠儘速提出修法。」
若想讓公投制度更清楚嚴謹，律師建議，在提案遞件時，就要有更具體的法律條文。
律師詹豐吉：「以核養綠或任何一個條文一樣，第一條把你的訴求你的目標，你達成步驟都把它寫的清清楚楚，公投法要修正就是減少（政府）操作空間。」
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