復航客機墜河意外，到底為何發生？原因大家都在追，外傳有復航機師跳出來爆料，說事故班機當天其實已經是飛第3趟了，同架班機早上7點半就已經從台北飛往金門，但是在從金門飛回來的時候，機長發現左引擎怪怪的，要求檢修，但地勤還是要求飛完這趟再說，否則會被民航局罰錢，對此，復興航空嚴重否認，但事實上，有問題的是另外一架早班飛機，因為防風鎖故障，才會拖回機坪檢修，確認無誤之後才放飛。
機棚外頭，復興航空ATR72型飛機，排隊等待檢修。發生墜機意外，外傳，復興航空機師氣不過跳出來爆料，表示說，事發班機當天已經飛了第3趟，同一架飛機、同一位機師，早上7點半就已經從台北飛金門，但是再從金門飛回來的時候，機師就已經發現左邊引擎出問題，要求檢修，但地勤檢查通信系統發現沒問題，就要機師飛完這趟再說，沒想到，剛起飛就出事。
復興航空總經理吳滬生：「我們嚴重澄清，並且告訴各位媒體朋友，我們沒有這件事情，同時我也可以出示，當天，當天駕駛員簽放，周圍的人簽放的證明，同時我們也把這些正本送到民航局。」
拿出檢修單據嚴重否認，不過民航局也發現，另外一架早班飛機，B-22806飛馬公，是ATR72-500的機型，垂直尾翼的操縱面故障，也就是飛機停放地面上，防止強風吹壞或吹歪垂直尾翼的設備，當天再飛行前解鎖後，發現有問題，檢修40分鐘之後才放飛。
復興航空總經理吳滬生：「806的發動機是螺旋槳鎖住，螺旋槳鎖住，經過我們機務的調整以後，重新調整就放飛了。」
雖然不是同一架，但是事故班機在交機時疑似就有問題，從法國土魯斯機場移交後，去年4月19日從曼谷飛往台北，沒想到飛到香港上空，左引擎疑似故障，滑油低油壓警示燈亮起來，只好緊急轉降澳門，等到21日從澳門飛回台北時，又再出現同樣問題，緊急轉降高雄小港機場。
這架事故班機，從去年4月換過發動機，去年8月，疑似也因為滲油外洩再換過一次。民航局也開始展開，全台ATR72機型總體檢，包含復興航空有10架，從2月4日深夜開始檢修，1天之內要全部檢修完畢，立榮航空也還有12台，預計在2月6日前要查完，通通都要等到檢查完畢，才准放飛。
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