凱米颱風過境重創南部，造成台南市多區的排水堤崩壞、防洪系統嚴重淹水災情，有立委指出，此次颱風不僅民生受災嚴重，就連農漁業都損失慘重。對此，台南市水利局表示，除了改善淹水問題，並會預計向中央爭取20億元經費，改善麻豆、安定的排水、防洪系統。預計完工後能大幅度提升排洪能力，若未來大水再度襲來，避免易淹水區居民再度深受水患困擾。
據了解，此次凱米造成麻豆、後壁、安定等區遭受淹水災情，民進黨立委郭國文於1日勘災時指出，「超越八八風災降、雨量的凱米颱風，即便許多抽水站、滯洪池都有發揮效益，但因為降雨量過大，導致許多地區仍舊淹水。」郭國文指出，若要進一步興建的抽水站、水門、排水系統與滯洪池等，加起來已逼近水利署可負荷的預算。
此次颱風為麻豆地區帶來總降雨量達879毫米，3小時最大降雨量更達198毫米，均已超過防洪保護標準，造成小埤、苓子林、港尾社區積淹水災情。另一條主要排水系統總爺及東北勢排水，也受到強降雨及外水高漲影響，造成北勢里及北勢國小嚴重積水。而安定區安順寮排水位高漲，內水無法順利排出，僅能依賴機械抽排將內水排除，故造成港尾、港口、港南里等聚落有淹水災情。
水利局表示，市府將向內政部國土管理署爭取5.56億，於埤頭橋旁興建小埤抽水站（28.8cms）及4公頃滯洪池，經費計5.56億，將可大幅提升埤頭里及麻豆市區防洪能力。另外還將向經濟部水利署爭取排水護岸系統性治理，所需經費約12億元。針對安定地區，水利局指出，包含增加港口中抽水機組，將原先3 CMS抽排量提升至4 CMS、新建中榮里抽水設備及下洲子抽水站二期新建工程等，將向中央爭取工程總經費約為2億5,300萬元(含用地費)，預計爭取治水工程經費為20億。
對此水利局表示，因為此次凱米颱風豪雨雨勢持續時間過長，轄內64座抽水站及492臺大型移動式抽水機全力投入防颱，同時也向中央申請調度抽水機，其他縣市政府也有提出支援意願，除了台南市既有的移動抽水機外，但對於轄內抽水機系統是否夠用，都還是要依照每次颱風帶來的豪雨災情進行應變。針對此次治水工程需要改善的部分，水利局仍在詳細盤點中。
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