繼屏東海生館、新北國立台灣圖書館，昨（16）日晚間澎湖水族館也接到炸彈匿名恐嚇信，館方表示，昨日深夜約10點半左右，犯嫌利用官網匿名留言，揚言在館區女廁安置9顆遙控炸彈，將於今（17）日上午11點引爆第一顆，館方隨即報警，警方深夜11點封館搜索，並未發現可疑爆裂物，為以防萬一，今日上午開館進行二度搜查，至今日上午11點才撤離，同樣未發現可疑物品。
警方追查，犯嫌同樣是利用境外IP發出匿名信，因近日類似恐嚇案不少，後續也會持續追查犯嫌，館方則表示，目前警戒都已解除，遊客預約和活動照常進行。
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