台北市議員林穎孟昨（12）日晚間指控台北市政府讓日本贈送來台的AZ疫苗「放到過期」，還將過期疫苗注射在人身上。台北市衛生局今日上午表示，這是醫院人員在上傳資料時將「批號」誤植，民眾實際上接種的疫苗並沒有過期。對此柯文哲表示，上傳批號確實是搞錯了，因為這段時間太多種疫苗了，所以才會發生錯誤，不過柯也強調，「請議員放心，台北市不可能藏疫苗，也沒有施打過期疫苗」。
台北市長柯文哲表示，昨日議員指控說北市府疫苗放到過期還施打、甚至藏疫苗，語意略酸「議員辛苦了，晚上十點要發新聞稿」。柯文哲要議員放心，中央撥多少疫苗下來，北市府就打多少，因為每一支疫苗要打的時候都有登錄，所以絕對不可能藏疫苗，也沒有地方藏，撥多少就打多少。至於疫苗是否過期，衛生局在昨日晚上立刻啟動調查，查到半夜一點，發現是批號上傳錯誤，並非過期。
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柯文哲說，當時中央將批號「K004C-CDC」的疫苗撥下來時，就只有兩個禮拜的時間可以打，不過其他國家送的疫苗，北市府也不可能挑三揀四，苛責對方送快要到期的疫苗。柯文哲強調，中央只要發下來，地方就會認真執行施打，還好台北市的醫療院所夠多，所以就找到了63家院所施打完畢。
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柯文哲坦言，這次錯誤確實是因為太多種疫苗在打，而每種疫苗又有不同的批號，上傳登錄時拉錯批號，後續也會研擬相關的「防呆裝置」，看是否已經完成登錄的批號，就從下拉的螢幕中拉掉，減少上傳錯誤的機會，會再和醫療院所討論，也強調醫療本來就是要求精確。
台北市衛生局疾病管制科長張惠美補充說明，北市府9月18日獲得中央配撥的1500瓶批號「K004C-CDC」的AZ疫苗，效期只有兩周，到10月3日為止，而台北市也要求所有醫療院所盡速接種，如果有施打速度比較慢的，就調撥到有需要的醫療院所，台北市也加開長者AZ的醫療門診，總共1500瓶配給63間的醫療院所接種，其中也包含洗腎診所。
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張惠美表示，醫院在這段時間內是非常辛苦的，接種疫苗的量非常大，醫事人員在接種之後，都會將民眾的接種紀錄，逐批上傳到系統裡面，不過中心綜合醫院的工作人員，在上傳的時候，沒有更新電腦資訊系統的批號，選到了「舊的批號」，才讓民眾查詢接種紀錄時，誤以為打到過期疫苗。衛生局也將持續向醫院進行稽查，並加強行政指導，要求「三讀五對」，確定接種的廠牌、劑量及批號，維護民眾安全。
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