為了全面防堵新型流感入侵，全國各港口也提高防疫措施！只要是想入港停泊的船隻，上頭有外國籍人員，就必須向疾管局書面申請檢疫，包含量體溫等十個項目，要是有疑似發燒等症狀，就會派醫師登船處理，另外，包含小三通等旅客，只要是搭船抵台的，都要通過紅外線體溫儀，確定沒有發燒才能入境。
小三通港務人員帶著口罩，將新流感宣導傳單發給每一位旅客，還有遠紅外線偵測儀，從螢幕上直接辨識有沒有旅客體溫過高，有沒有感染跡象，只要是超過溫度的，黑白螢幕就會有警示。
對岸傳出疑似新流感病例，小三通格外緊張，而30日迎接1200名陸客的基隆港，則是出動這一種V8型的行動顯像儀，將會架設在通關口把關，或是由疾管人員拿著，登船檢查，為了防堵疫情各大港口繃緊神經。
高市疾管處人員：「旅客部分，加紅外線體溫監測，如果像台華輪，兩岸三地這樣跑，目前設置在馬公。」
不只要注意旅客，根據傳染病防治條例標準程序，只要船上有外國籍人員，船公司在入港前4到72小時，書面申請檢疫，包含量體溫等十項檢驗項目，合格當然沒問，要是不合格，疾管局將會派醫師登船檢疫。
第一線的海關、港務人員，已經戴上口罩避免感染，疾管局避免疫情進入台灣，務必做到滴水不漏。
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