財政部的房地合一稅制公布後引發大爭論，就是因為內容限制自用住宅獲利超過400萬，就得課10%稅負，比起日本有810萬的門檻限制，甚至法國規定一戶自用住宅免稅的規定而言，台灣相對相對台嚴苛，房仲說這就像把自住客全面都成了投資客，尤其持有期間的土增稅、房屋稅等不能扣抵，如果稅制真的過關上路，對自住客來說賣屋壓力也成了課稅壓力。
房仲業務員陳泰源：「過去這5年來平均的漲幅1年就有1成的漲幅。」
20年老大樓地點好，所以漲幅驚人，但套上財政部房地合一稅制版本，未來如果要賣屋，連自住客都得多繳稅。
因為舊版本規劃交易總金額在4000萬以下就不課稅，現在改成以獲利400萬當基準，超過的都要課10%，以這間中古屋來說，就算是自住沒有出租，持有超過6年，照樣得掏出10%稅負。
房產專家田大權：「賦稅署是用一個2千萬的房子為例，每年漲3%，也就是60萬，連續持有6年，是不是360萬，算一個整數400萬這樣子算出來的，這一個計算的方式，它是以房價持續上漲為前提，但是財政部認為房價不會上漲了，這時候可能出現一個邏輯上的問題，就是說如果房價不會上漲，房地合一實價課稅又是所得稅的話，那收得到稅嗎？」
稅制結果與立法初衷不只出現大矛盾，更大爭議是太過嚴苛，因為在法國出售住宅，可以享有1戶免稅優惠，至於在德國，持有3年以上的自用住宅也不用繳稅，日本自用住宅的免稅額是訂在台幣810萬。
房產專家田大權：「400萬這種絕對數字一出來之後，其實它已經無所謂高低的問題，反而市場會找到另外一個空隙，也許會炒作中低總價或是低總價，因為我們看到其實像現在南部或者其他非大台北地區之外，從800萬漲到1200萬的房子非常非常多，如果1千萬賣到1500萬，獲利是5成耶，5千萬的房子賣了5500萬，獲利只有1成，獲利率完全天差地別，但是稅制是一樣，這到底哪裏有問題。」
不同的獲利率卻課同樣的稅，讓專家看了都納悶，再加上對自住客而言，好不容易攢錢買了房，想不到在財政部眼中也是炒房投資客。
房仲業董事長王應傑：「現在房子賣了要繳土增稅，一定要繳土地增值稅，還有持有年限裡面，繳的房屋稅和地價稅，甚至你銀行貸款利息都應該列入你的成本扣除，這樣再來課，譬如說10%，那我會覺得說很合理，我所有的成本政府(如果)不承認，你要怎麼說什麼是房地合一制。」
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