氣象局在宜蘭外海設置海底纜線，成為海嘯預警的第一道防線，整個系統英文縮寫簡稱的中文諧音、被稱為「媽祖計畫」，但沒想到引起其他宗教團體不滿，質疑政府機關獨尊特定宗教，甚至說萬一計畫失敗、難不成也要怪神明嗎？還發出電子信箱灌滿氣象局，信眾有的人支持，認為應該改名，但也有些民眾認為小題大作。
氣象局在宜蘭外海建置海嘯預警系統，正式名稱長達23個字，「台灣東部海域電纜式海底地震儀及海洋物理觀測系統」，念起來落落長，英文縮寫簡稱的中文諧音，取名媽祖計畫，原以為好記好背又討喜，但沒想到觸怒其他宗教團體。
基督教會朱台深牧師：「不要獨厚任何一個宗教，或者是神明，政府單位實在不需要譁眾取寵。」
基督教團體發起一人一信寄到氣象局，反對取名媽祖計畫，質疑氣象局假藉公帑行個人宗教宣揚，還說萬一計畫失敗難不能也要怪神明不喜悅嗎？話說得不輕，但也有不同信仰的人，態度相對輕鬆。
媽祖信眾：「不受影響任何宗教都是可以的，那只是諧音而已，沒有特別對某個宗教，特別尊崇或排斥，沒有啦。」
氣象局被抗議信件轟炸，已經不敢再公開提到「媽祖計畫」，原本取諧音，是援引她庇佑人民的精神，取名花心思、沒想到弄巧成拙。
