新冠疫情影響台灣至今已經造成211名兒童重症，當中更有32人死亡。衛福部長薛瑞元表示，疫情燒出「台灣兒童醫療網脆弱」嚴重問題，憂心國內醫療無法因應大量兒童急重症，未來兒童罹患重症會往國外送。因此，先前規劃11億元建構兒童醫療網，現在要擴大金費，建立更完善的兒童照護醫療，這也是他上任後首要施政任務之一。
新北市2歲男童恩恩是國內首例兒童染疫死亡個案，衛福部長薛瑞元今（17）日出席中華民國兒童健康聯盟舉辦的「新冠肺炎COVID-19對兒童及家庭之影響」研討會時表示，新冠疫情期間，醫療人力根本無法應付出現大量、緊急需求，如果沒有整合資源，恐怕未來兒童罹患重症就「得跑到國外就醫」。薛瑞元表示，這次疫情讓大家看到國內兒童醫療資源網的脆弱，包括很多區域級醫院兒科都幾乎是棄守，就算有，也只剩下少數門診，甚至住院也是幾乎能縮就縮，連一般病床都無法運做。
薛瑞元表示，上任後首要施政任務之一，就是要優化兒童照護醫療網，根據醫事司的報告，現在優化兒童醫療有三項重點：包括「建立核心醫院」專責處理兒科重症疾病，同時負責訓練有能力處理重症的醫師；「處理急症」則是在每縣市成立一家專責醫院，要有足夠能力處理兒科急症，避免耽誤病情；「建立基層的幼兒專責醫師」，則是小孩出生後要指定專責醫生，追蹤健康狀況、施打疫苗。
薛瑞元表示，原本醫事司編列11億預算，但顯然是不夠的，目前已經要求同仁把修正計畫範圍擴大，爭取經費，薛瑞元表示「必須維持我們醫療量能在處理重急難罕這樣的疾病」才不會造成以後兒童生病後都往國外送的狀況。
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