新冠疫情爆發以來，最辛苦的莫過於守在第一線的醫護，指揮中心也提出「執行嚴重特殊傳染性肺炎醫療照護及防治發給補助津貼及獎勵要點」，不過卻是爭議不斷，現在又有網友在PTT爆料，指控在集中檢疫所工作，但防疫獎金卻在最近遭到「追回」，對此指揮中心發言人莊人祥回應，原本不確定兩間集中檢疫所是不是有收確診者，不過現在已經認定，所以不用繳回。
醫護防疫津貼爭議不斷，先是上個月有網友曬出防疫獎勵到帳僅67元，最近又有PTT一名網友在26日於八卦版爆料，說「那時候說防疫獎金一定會給，原本掌事的跑去選舉了，換新的人當家之後就追回，什麼原因收回也沒說，檢疫所也都有支援，有沒有醫護人員跟防疫人員就是韭菜的八卦。」同時附上收到的公文，公文上主旨寫「追回110年5~7月支援加強版草屯、中興集中檢疫場所工作人員津貼補償加發一倍之工作津貼詳如說明」
內文說明則是寫，有無法確認收著對象為新冠確診個案情形，因此追回已核發予工作人員之加發一倍津貼，且限期8月31日前將遭撤銷津貼繳回。
對此指揮中心發言人莊人祥回應，「集中檢疫所如收治確診者，人員防疫津貼會加倍給付，本來是疾管署對中興、草屯兩所收治住民是否為確診者有疑義，經兩所補件說明後，已獲本署理解、認定，故毋須繳回加發之防疫津貼。
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