為了加速兒童疫苗施打，中央在六都開設大型接種站，希望能加快施打的進度，但這些疫苗，卻是從其他縣市政府調配，引發不少縣市不滿，包括雲林被縮減了2300劑，南投也有3000劑被延後，嘉義市更是6100劑全被延後，不少地方民代出面痛批，難道非六都孩子的命，就不是命嗎？但對此指揮中心昨天還是強調，絕對沒有調配疫苗支援六都的問題。
雲林縣長張麗善：「所以要調撥到這個南區的大型施打站，所以就將我們本來，他答應我們的5600劑的疫苗縮減成2300劑。」
張麗善說他們問了才知道，被抽掉的疫苗拿去台南的兒童疫苗大型接種站了，已經嚴重影響縣內孩子預定接種時間，只好向其他縣市借疫苗，其實不只雲林，苗栗縣原本5月31日中央要撥4000劑兒童BNT也被抽走，部分疫苗剩2500劑撥到地方來，南投縣原訂5/30有3000劑兒童BNT，中央說暫時先不給，嘉義縣2000劑暫緩補撥，甚至嘉義市原本說好6/3要到的6100劑也「全數先不給」。
不只藍營民代急阿，轄區綠營立委也呼籲中央說清楚。
民進黨立委王美惠：「為什麼指揮中心要讓每個縣市要再拿回去，這不是拿回去了，這是一種彈性調配空間，所以希望指揮中心可以出來說清楚，不要讓百姓擔心。
在地民眾更是氣炸了。
民眾阿伯：「六都小孩都比較好命嗎？六都是人，其他的都不是人嗎？我們稅金也都有照樣繳啊，現在是疫苗不夠，還是怎樣，他要說清楚，六都會孩子就比較幸運，啊其他縣市的孩子就比較不幸了。」
立法院副院長蔡其昌到台中的大型接種站，不斷強調這是他努力爭取來的，但被問到是否搶走「非六都」孩子們疫苗？
立法院副院長蔡其昌：「沒有搶啦，因為你請CDC公布嘛，我相信他分配的比例都是很清楚的，因為我們整體的疫苗採購量，那疫苗是分批進來的。」
防疫指揮中心指揮官陳時中：「都沒有從大家，從這裡面去調配他的量來做大型施打站使用。」
指揮官再次強調，沒有縮減到其他縣市疫苗。
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