環保團體綠色和平發布最新報告指出，台灣雖然擁有豐富海洋資源、海洋生物超過上萬種，不過由於欠缺完善的法規保護，加上過度捕撈、氣候變遷等因素，造成許多物種都面臨生存危機。綠色和平點出，政府主管機關劃設了許多海洋保護區，但執法不夠嚴格、管理不夠完善，導致近年來盜獵的案件層出不窮，政府的保育工作必須更積極嚴謹，海洋資源才可能永續發展。
TVBS記者戴元利：「綠色和平組織發布一份調查報告指出，台灣擁有的海洋生物多達1萬1700多種，不過禁止捕撈採集的卻只有88種，如果沒有善加保護，恐怕有更多物種將面臨滅絕危機。」
綠色和平組織綜合各項數據點出，台灣海洋生物多元豐富，光魚類就超過3000種、占全球的10分之1；另外全球7種海龜、有5種在台灣現蹤；國內還有700多種珊瑚，也占全球珊瑚種類的3分之1。然而在愈來愈多海洋生物面臨生存危機的情況下，台灣卻只有88種被明令禁捕，保護力道顯然不夠。
海大環境生物與漁業科學系教授莊守正：「這個種一般我們叫做，叫做紅肉ㄚ髻鮫那這個鯊魚很有名嘛，很有名的原因是因為牠體型非常的特殊，牠的頭立起來像個榔頭一樣。」
國內鯊魚研究權威、海洋大學教授莊守正，對瀕危的鯊魚種類如數家珍。
海大環境生物與漁業科學系教授莊守正：「這個是胚胎大白鯊，基本上可以長得很大，我們台灣總是偶爾會抓到、數量也不是很多，現在抓到一年的數量大概是在個位數。」
全世界鯊魚600多種，光在台灣就看得到150種，不過其中40種，已經被瀕臨絕種野生動植物國際貿易公約列入附錄二，也就是數量稀少必須有效管制。不過莊守正坦言，由於許多海洋生物傳統上是經濟物種，更是許多家庭餐桌上的蛋白質來源，想全面禁捕，實務上有難度。
海大環境生物與漁業科學系教授莊守正：「傳統上是我們蛋白質的來源，所以你今天要擬定這些策略的時候，它顯得就相當的複雜，你要考慮的層面很多，你要考慮到很多不同的族群，有些人漁民抓這個的，或者是有人專門在吃這一類的類似這種，所以不能說鯊魚所有的種類全部列入禁捕。」
從2000年開始，莊守正率領研究團隊，透過衛星定位，對台灣鯨鯊、也就是俗稱的豆腐鯊，進行洄游路徑等生態調查，由於豆腐鯊性情溫和、容易獵殺，已被國際列為瀕危物種，2008年，雖然台灣自發性公告禁捕，但13年過去了，豆腐鯊繁衍狀況為何，仍有待長期追蹤調查。
北市大地球環境生物資源系助理教授廖運志：「禁捕之前你要先做功課，你要知道哪些(物種)是變少了，其實我們對很多的調查還是不夠，國外是這樣子的評估，可是我們國內的狀況如何呢，我們沒有做一個比較完整的基礎調查，而且不會持續地去做這件事情，這就是我們一直都很缺少的，基礎的生態調查資料。」
海保署發言人吳龍靜：「我們透過海洋保護區的整合平台，進行橫向的聯繫，大家針對所劃設的這些保護區來，共同努力提升它的管理機制，以及生態的調查。」
事實上，近年主管機關陸續劃設出46個海洋保護區，而且數量仍在增加中，不過劃設之後，還有許多工作得進行。
北市大地球環境生物資源系助理教授廖運志：「劃了這個資源保護區，可是它的這個調查的力道不夠，就是說這個資源到底還在不在，那它資源到底是多還是少，再來它沒有很好的管理，那也沒有辦法去比如說有違法可以舉證，那這樣子的一個執法的力度上面，其實一直都是很不夠的。」
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