台大校長管中閔在2018年準備上任時，碰上「卡管案」，教育部指出遴選過程有瑕疵導致他在隔年才上任，造成3位教育部長下台，其中第一位下台的潘文忠現在也回任，日前管中閔在台大校務會議時表示不續任，被認為是要避免再次紛擾，潘文忠今（27）日出席立法院教育預算審查時不願回應對此事的看法。
台大校長管中閔重申就是因為世代交替因此不續任校長職位，有政治心思的人才會有政治解讀，沒有什麼好慰留的，話出口就不會改了。
教育部長潘文忠，被《TVBS新聞網》問到，當初是第一位因為管中閔案下台的教育部長隨後才回任，對於此事有什麼看法？他避而不答，只說先讓他整理資料。
隨後潘文忠接受媒體聯訪說，大家都期待管校長帶領大家向前行，確實他在他的任期內投入校務發展，依照《大學法》校長1任4年也可以再續任，相關的法規、程序都依《大學法》作業，管校長在校務會議的宣布應該給予尊重。
他說明，因為依照台大的組織規程，確實要續任校長要校務會議過半數同意，尊重學校相關作業，他任期還有1年多，是在作業時間點徵詢他是否續任，並不是說過與不過，這是學校規定。
外界質疑他不續任是因為潘文忠是卡管案期間的教育部長，因此擔心紛擾才不續任，潘文忠回應，評鑑是整理校長任期中辦學成果，再送請校務會議，他們才是最關鍵的因素。
他強調，台大是教育部所屬的教育機關，不應該讓這些紛擾造成學校教育無法正常運作。
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