台灣在5月中新冠肺炎（COVID-19）疫情大爆發，並從當時進入三級警戒至今，當時外界認為，是因為放寬機組員檢疫期為「3+11」，才導致疫情破口。不過，指揮中心專家諮詢小組委員李秉穎卻說，專家會議中從未討論過「3+11」，那是指揮中心自己的會議，消息一出，引發網友一陣嘩然。
李秉穎聽完後回應，專家會議從未討論過「3+11」，也從未講過心軟的事情，更直言「3+11」是指揮中心自己的會議，也許指揮中心有許多不同會議，但並未在專家會議中討論過「3+11」，強調自己從未參與該項討論。李秉穎更指出，千萬不能縮短隔離期，以英國變種病毒為例，就是因為縮短隔離期才進來的。
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