針對國籍機組員防疫，原先5+9的隔離措施，也就是5天居家檢疫，和9天加強版自主健康管理，被改成3+11，居家檢疫縮短兩天，被認為是防疫破口，疾管署(5/31)拍板政策轉彎，從6月12日後，沒有接種新冠疫苗的長程航班機組員，又要回歸「5+9」模式，加強隔離。
指揮中心發言人莊人祥：「都有機上全程的防護啦，這個我們會提供相關的手套、口罩的部分，是返國後居家檢疫採檢跟自主健康管理的措施。」
要把3+11的隔離政策改為5+9，也就是五天居家檢疫和九天加強版的自主健康管理，只是政策會急轉彎，是因為衛福部長在立院諮詢時，受到國民黨立院黨團提出的要求。
疾管署透過文字說明，說部長在28日被要求需要在31日下班前，提出3+11及BNT疫苗取消EUA的報告，而報告中還提到6月12之後，對於沒有接種COVID-19疫苗的機組員，隔離措施加嚴，調整為5加9。
指揮中心發言人莊人祥：「主管機關他已經有督導，外站的一個零接觸的管理，還有整個機組員的管理，都有上了軌道。」
隔離政策修改，疾管署強調是經過中央疫情指揮中心監測、邊境檢疫社區防疫、醫療應變小組和專家討論的結果，針對疫情滾動式修正，對於機組員的隔離自主管理，也會嚴格落實零接觸管理，加強機組員的防護措施，杜絕所有可能的防疫破口。
《TVBS》提醒您：
因應新冠肺炎疫情，疾管署持續疫情監測與邊境管制措施，如有疑似症狀，請撥打：1922專線，或 0800-001922。
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