西方情報評估指出，美國與以色列對伊朗持續數周的空襲，已使德黑蘭政府體系出現分裂。知情官員表示，大量高層官員在戰事中喪生，倖存官員擔心通訊遭情報機構攔截，不願透過電話聯絡，也難以面對面會晤，使政府難以整合出一致立場。談判代表因此不清楚能讓步到何種程度，甚至不知道該向誰請示。
《紐約時報》報導，自戰爭爆發4週以來，已有數十名伊朗高階官員及其副手喪生。官員指出，伊朗政府的安全與軍事機構仍在運作，但制定新戰略與政策的能力已大幅削弱。美方政府則稱，目前伊朗已有新政府掌權，並對其施壓要求迅速達成協議，但伊朗決策能力下降，反而使談判變得更加困難。
最高領袖身亡 權力結構仍不明
戰爭初期，以色列空襲伊朗最高領袖官邸，造成最高領袖哈米尼及多名國安高層身亡。西方官員表示，這場襲擊切斷了伊朗安全部門、軍方與民事政策制定部門之間的大量聯絡。現任最高領袖穆吉塔巴（Mojtaba Khamenei）至今未公開露面，美以情報機構認為他在戰爭中受傷，部分情報人士認為他可能只是象徵性領導人，實際決策權掌握在伊斯蘭革命衛隊手中。
指揮體系受損 報復能力仍存在
一名美軍高級官員表示，美以空襲已嚴重削弱伊朗的指揮與控制系統。不過伊朗在戰前建立了去中心化指揮體系，即使缺乏德黑蘭直接指令，各地指揮官仍可自行決定發動攻擊。美方已將這些地方指揮官列為打擊目標。
儘管指揮體系受損，伊朗仍具備發動攻勢的能力，例如上周對沙烏地阿拉伯蘇丹王子空軍基地（Prince Sultan Air Base）發射飛彈與無人機。但美國前官員指出，由於領導層傷亡慘重，伊朗難以發動更大規模、協同程度更高的密集攻擊，多數反擊由各地指揮部各自組織，缺乏統一協調。
美國總統川普30日警告，若短期內無法達成協議，可能擴大戰事，甚至暗示美軍可能奪取伊朗石油樞紐哈爾克島。他也表示，若荷姆茲海峽持續關閉，美軍可能打擊伊朗的發電廠、油井與海水淡化設施。知情人士指出，川普的不滿正反映出伊朗政府內部混亂，難以就美方提出的和平方案做出最終決策。
