北京奧運即將在8月舉行，可能很多人已經發現，水立方和鳥巢並沒有在一個平行線上，其實原本的規劃，從空中鳥瞰這2棟招牌建築應該要並行，不過當地盛傳，當初要興建水立方場館時，正要拆北頂娘娘廟時，突然刮起龍捲風，造成工人死傷，奧運當局隨俗不拆廟，讓水立方足足後退100多公尺。
民眾：「是龍捲風…，龍捲風！」
2004年8月27日，突如其來的一陣怪風，吹進了「水立方」工地。民眾：「你看那房子，倒了倒了，把房子也拆了。」
7公尺高的風柱，將可以抵抗7級風力的臨時工地幾乎夷為平地，大量的鐵片在空中飛舞，走避不及的工人被鐵片刮傷，意外造成44名工人受傷、2人死亡。北頂娘娘廟博物館人員文愛群：「當時北頂很多神像在文化大革命期間，就被推在後牆的一個大坑裡，工作的臨時建築，給疊壓在這個北頂娘娘的後牆上。」
當時奧運當局為了要建造「水立方」，決定將四周圍的古老建築物都拆除，沒想到，當工人準備拆卸隔壁的北頂娘娘廟時突然刮起大風，當地人都認為北頂娘娘發怒了。
這起意外也促使當局決定保留廟宇，而原本應該與鳥巢平行的水立方，也後退100多米，北京當局於是決定，將北頂娘娘廟重新打造修復改建成博物館，讓這座極有文物價值的廟宇繼續聳立，並且與現代建築「鳥巢」、「水立方」相互輝映。
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