台南市長賴清德將北上接閣揆最大難題就是要如何跟蔡總統磨合，因為兩人的個性都是比較堅持己見，立委就點出未來兩位強勢的人硬碰硬，政局不會穩定，尤其現在總統總被認為是政策的主要領導者，因此外界也分析賴清德所屬於的新系，可能將會針對閣揆權力議題做攻防，希望行政院長可以制衡總統。
賴清德市長稱謂要換成賴院長，得迎接的挑戰，首要就是跟蔡總統合作無間。蔡英文、賴清德兩人都是硬脾氣，會不會硬碰硬，考驗兩人默契。
民進黨立委尤美女：「做事其實就是你有時候要果斷，才能夠讓整個事情做得好，但是做事果斷不表示人和就不好，我相信他跟小英總統之間一定能磨合得很好。」
點出蔡英文對於政策的掌控性高，被質疑職權一把抓，內閣等於沒實權，總統權力是不是該釋出一點？賴清德屬於的新系早有攻防。
立法院副院長蔡其昌：「如果有人正式去主張一些憲政上的議題，我想有人講了之後，社會才值得去討論去回應，內閣制跟總統制的討論，大概我從第二屆35歲近來立法院已經討論到現在。」
賴清德長期耕耘台南，台獨議題早些年沒爭議，只是步步接近中央，想走中間路線說出兩岸求同存異，引發爭議。
兩案論述總被打臉，甚至傳出一開始內閣要找的是高雄市長陳菊。
高雄市長陳菊：「需要有更多優秀的人，那賴清德是我見過新的世代之中最有擔當，最有勇氣、能力最好，我認為由他來承擔，沒有誰比他更適當。」
賴清德的難題不少，以前在地方跟議員吵架，選民吃這套，但未來到了立院，如果還是跟立委硬碰硬，恐怕沒成效反被酸。
國民黨立委李彥秀：「賴清德在台南市議會的性格如果轉到立法院來，我相信接下來可能國會的火爆場面，當然也有可能會很多。」
賴神北上掌內閣，行政處事都得調整，轉換成中央模式。
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