馬總統運動最愛慢跑，但週刊報導，在去年(104年)11月，馬總統參加公益路抵達終點時，突然發生呼吸急促休克的狀況，差點跌倒在地，被隨扈扶回官邸休息，還得用氧氣罩協助呼吸。不過對此總統府已經嚴正否認，表示馬總統當天只是熱身不足，腳和腰才會突然不舒服，脈搏心跳都一切正常。立法院長王金平也說，上年紀膝蓋最重要，認為快走比較能保護到身體。
公益路跑才到終點，馬總統突然一個踉蹌，往前傾倒，，差幾秒就要撲倒在柏油路上一旁隨扈嚇一大跳，趕緊上前攙扶，但馬總統仍無法恢復，只能先回官邸休息，周刊報導，一度傳出馬總統呼吸困難、休克，還要用氧氣罩，而且終身不能再跑，但府方澄清否認。
總統府發言人馬瑋國：「馬總統當天起跑前暖身不足，運動時造成腰部腿部不適，但絕無所謂休克、跌倒情況，總統在跑完5公里後，自行返回寓所，休息後已無問題。」
總統府發言人馬瑋國：「馬總統當天起跑前，暖身不足，運動時造成腰部腿部不適，但絕無所謂休克，跌倒情況，總統在跑完5公里後，自行返回寓所，休息後已無問題。」
總統路跑腿軟，發生在2014年11月15日，當時距離九合一選舉只剩2個禮拜，總統參加公益路跑，發生小插曲，被一旁自拍跑者洽巧拍下，意外外發生後，馬總統每天還是照常運動，使用健身房跑步機，或在寓所跑步。
記者vs.立法院長王金平：「快走膝蓋比較能受到保護，不至於有比較嚴重的傷害，上了年紀， 膝蓋最重要，建議他那麼做？他自己知道怎麼做。」
記者vs.經濟部長鄧振中：「總統身體狀況很好呀！傳出他去年路跑，好像有休克？我不知道這一方面，但是我和他見面的時候，總統的身體都非常好。」
總統愛慢跑，無論出訪甚至下著大雷雨，只要有空檔就會換上短衣短褲慢跑運動，但上次年度健檢，醫生也發現馬總統膝蓋有輕度關節炎，建議運動改成游泳，這次意外，知情人事透漏，是馬總統在抵達終點前衝刺太快才會腿軟，也讓大家虛驚一場。
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