對於食安問題，台北市長柯文哲成立食安委員會，並且為了加速下架和自主通報時間，縮短到24小時內，擬定「食安自治條例草案」，最快一年後上路，而柯文哲選前承諾成立的「國際級食品安全檢驗中心」，衛生局也在評估中！專家認為，找到食安專業分析人員，比設備升級更重要！
高規格檢驗設備，這裡是台北市衛生局的精密儀器檢驗室。
精密儀器檢驗室人員(2013.10.24)：「棉酚的標準值，大概只要7分多鐘，就會跑出一個高峰值，馬上就可以知道油品裡面有沒有摻雜棉酚。」
這是2013年，大統油品引發的棉籽油食安危機時，精密儀器檢驗室對外顯示檢驗功力，這裡配置3部要價千萬儀器，專門檢測三聚氰胺、塑化劑、瘦肉精、動物用藥和農藥，台北市長柯文哲在選前的「市政白皮書」中，提到將成立國際級食品安全檢驗中心，對於相關設備升級，和人員編制增加的需求，衛生局也在進行評估，專家表示，「人」比「機器」更重要。
台大農業規劃發展研究中心主任許輔：「六都(食安檢驗)設備都慢慢在提升中，但各縣市的還跟不上，但是還有一個困難的是，人員分析、專業分析，人員的部分，專業分析人員還要更長時間培養，就是說我們有飛機，數量夠了，飛行員還不太夠，真正可以去作戰的，可能還不夠。」
展現對食安嚴格把關決心，台北市政府擬定「食安自治條例草案」，未來只要一爆發食安危機，以往自主下架，只要求在5天內完成，新版食安自治條例草案，要求得在48小時內下架完畢；業者自主通報，也從3天縮短到24小時；網購平台下架，從5天縮短到48小時內，違者最高將處10萬元，可連續罰，甚至吊銷營業登記執照。
台北市衛生局局長黃世傑：「以往食安法裡面規定，自主通報大概3天，下架大概5天，民眾還繼續再採購不適當的產品，所以我們在自治條例裡面，就加快(下架)速度。」
另外在新版食安自治條例草案中，要求散裝食品要標明品名、產地等其他應標示事項，食品添加物業者得主動提供下游業者產品規格，檢驗報告，還包括這條窩裡反條款，檢舉獎金為罰緩金額50%。
台北市衛生局局長黃世傑：「食安有沒有問題，其實廠商的員工最清楚，可是以往他們都沒有把事情抖出來，我們這次特別提出『窩裡反』條款。」
台大農業規劃發展研究中心主任許輔：「很多母公司、大型公司，都設籍在台北市，所以他會強化它(自治條例)，好比說網路購物平台的下架，還有通路商。」
台北市食安自治條例草案，是希望補足中央食安法不足之處，柯文哲也組成食安委員會監督，但現實的地方在於，立意良善的食安自治條例草案，得經過議會和公聽會等法定程序，最快也要一年後才能上路。
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