國民黨台北市長候選人連勝文母親連方瑀，昨天輔選時，說連勝文遭槍擊時，柯文哲不在開刀房內，還說柯文哲自己說他是墨綠的，萬一連勝文有三長兩短，會有人說是他動手腳。柯文哲昨天一開始低調避談，後來強調他本來就是負責指揮、沒有開刀。據了解，當晚柯文哲是協調者，指揮各科醫生，柯文哲認為當時指揮得快，連勝文才會恢復神速。
2011年11月26日8點17分，驚天一響，連勝文臉部中彈，當時擔任台大醫院創傷醫學部主任的柯文哲，人正在監察院的餐會，9點接到通知，回程開始調派主治醫生。
台北市長候選人柯文哲(2013.9)：「我有去跟連講話，確定他意識是清楚的，一送到檯上做電腦斷層，我站在那裏看，當場決定調那些人，我就開始打電話，不用到急診室，直接送開刀房，我就在那邊指揮，血還沒淹出來就已經被開掉，這也是為什麼後來他恢復很快的原因。」
當時是選戰開票前夕，情勢非常緊繃，台大還特別徵召台北榮總院長的女兒，當藍營的證人，連方瑀輔選，說當時柯文哲曾經講過這段話。連勝文母親連方瑀：「尊敬的柯醫師是沒有在裡面的，因為他說他是墨綠的，萬一勝文有個三長兩短，人家會說是他動的手腳。」
當時氣氛下，確實有各種政治考量，醫界大老、國民黨立委蘇清泉，這樣定義柯文哲的角色。國民黨立委蘇清泉：「他的應該是一個協調者，他應該不是主刀者，只要把命救回來大家都有功勞，包括台大醫院院長也有功勞。」
柯文哲：「我只是指揮者，不是開刀的人，要感謝就感謝，不感謝就不感謝。」
國民黨台北市長候選人連勝文：「根據台大醫生轉述，好像我母親講的是事實，但我們還是感謝。」
柯文哲妻子在8月的時候還PO出紅酒謝卡，說是槍傷患者的謝禮，署名模糊字體，有網友猜是連戰跟連方瑀。但如今連方瑀感謝的醫生當中沒有對手柯文哲，糾葛的槍擊案竟也各說各話。
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