國安局是否提供資金，扶植大陸民運人士，對此，前國安局長丁渝洲表示，自己沒有簽過類似文件，而且質疑文件的真實性；至於總統府方面則強調，這是大陸一貫的技倆，根本不值得相信。
大陸聲稱的國安局極機密文件，總統府秘書長蘇貞昌直接了當的說，不足採信。總統府秘書長蘇貞昌：「我們看出軍事情報方面的虛虛實實，文章裡面提到的相關單位，相關人士都已經鄭重否認，如果我們還因此而大大的一番騷擾，也許正是他當時發布消息的目的，所以我們千萬不要中計，它那個公文的話，簽呈是呈給局長的嘛！那我已經離開國安局了，怎麼可能還會以局長的身分簽名呢！」
記者：「基本上就是時間點都不對。」蘇貞昌：「時間兜不攏，對！對！」記者：「簽名是跟你原來的簽名是一樣的嗎？」蘇貞昌：「不一樣啊！當然是有出入啊！」
而前國安局長丁渝洲在接受TVBS訪問時，也質疑文件本破綻百出。丁渝洲強調，他是在911前的8月16號轉任國安會秘書長，因此時間點根本不對，丁渝洲懷疑，這份文件是大陸方面在六四前夕，針對民運人士的一次嚇阻行動。
此外，被指接受民進黨政府資助的大陸民運人士盧四清，在香港也對此嚴加駁斥。大陸民運人士盧四清：「我想絕對沒有直接去接觸，去提到給我們一種援助啊！或是說給我們一種幫助啊！到目前為止，絕對沒有這樣的事情。」
至於海基會副秘書長顏萬進則表示，他確實與王丹等人有過接觸，不過僅止於意見交換，沒有金錢援助，顏萬進強調，這份文件根本就是假的。
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