混元禪師熟識的政黨人士，橫跨藍綠政黨，還先後為台北車站、華航看風水，甚至擔任總統府顧問，雖然有學者批評政府太相信怪力亂神，不過混元禪師強調，從來沒有為陳總統看過風水。
混元禪師帶著大批信徒，來到雲林慈光寺，舉行風水學的戶外教學，自從被披露他曾向許多政府單位或國營企業看過風水之後，他和政府高層之間良好的互動也備受矚目，他還是總統府顧問，還兩次說中陳水扁會當選總統，那麼陳總統是否也請他看過風水。
混元禪師：「第一次投票到第二次投票到現在，都沒去看過（總統）的風水。」
混元禪師與藍綠政黨的高層，都有不錯的交情，除了陳水扁，混元禪師也澄清沒有幫「師叔」，也就是親民黨主席宋楚瑜看風水，倒是問起行政院長謝長廷，他的回答更有趣。
混元禪師：「院長他有修行，非常成功的師父，他有他的師父在幫他。」
談到風水，混元禪師自有一套解讀方法，不過有學者批評他是怪力亂神，對此，也曾一起和混元法師敲想過和平鐘的副總統呂秀蓮，出面替混元禪師緩頰。
副總統呂秀蓮：「我覺得我們不必過於迷信，但也不必很多事情給它抗拒。」
呂副總統指出，風水學是中國人五千年來的智慧結晶，信者恆信，不信者也不防抱著寬容的態度看待，對於外界學者或是宗教團體抨擊混元，她也呼籲社會各界不需窮追猛打。
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