選戰還沒打完，民進黨內部派系間的閣揆卡位戰已經開打，謝長廷成為各派系的箭靶，讓謝系子弟兵開始護駕，直指若是敗選，該負責的是黨務系統，也就是蘇貞昌，而非謝長廷，不過與蘇貞昌關係密切的新潮流系則認為，若是敗選，謝長廷也有責任，雙方人馬槓了起來。
高捷弊案讓民進黨選舉陷入苦戰，也讓謝長廷成為各派系的攻擊箭靶，不只傳出正義連線力拱游錫堃回鍋接任閣揆，力挺蘇貞昌的新潮流系，也明指謝長廷就是該負責，派系操戈，謝系子弟兵再也無法沉默。
立委李文忠：「 主要原因不在黨務系統與候選人，而在中央施政不佳，坦白說我希望蘇貞昌當行政院長，行政院長是總統權責，我們不宜指三道四，如果敗選新潮流極有可能做黨內檢討。」
立委李俊毅：「這種檢討極有可能箭頭指向總統跟行政院長，我們都可以聞到這個味道。」
新系與謝系人馬槓了起來，追根究底，為的不就是2008總統卡位戰。假如民進黨敗選，蘇貞昌請辭下台，與蘇貞昌靠攏的新潮流系甚至不排除走自己的路。
立委李文忠：「(蘇貞昌)什麼位子不重要，做什麼事才重要，有些位子下場是致命毒藥不是嗎？」
立委李俊毅：「(新系)有點像小孩子騎木馬打仗，有點太兒戲。」
蘇謝人馬競爭激烈，陳總統嫡系正義連線也在積極尋找舞台，只是在選前關鍵時刻傳出跟陳總統建言要游錫堃回鍋，是不是其他派系放話？正義連線顯得很低調。
不管消息怎麼傳出，民進黨內派系間的明爭暗鬥已是不爭的事實。檯面上大家團結一心求勝選，檯面下各自機關算盡，尋求黨內發展一片天。
