提供元首國際情勢分析的「總統智囊團」國安會諮詢委員，被質疑是「給薪無法源」的黑官，新任國安會秘書長袁健生月薪30萬，跟五院院長同等級，底下諮詢委員薪水19萬，比部長月薪17萬還要高，不過這根據國安會組織法，只說諮委由總統特聘，沒說是不是有給職，國安會希望朝野立委儘快修法，讓總統智囊團拿薪水有法源。
只要遇到重大事件，馬總統就召開國安會議，但平常負責提供局勢分析的智囊團「國安會諮詢委員」，現在被立委質疑是黑官；依據國安會組織法，諮委由總統特聘但沒明定是有給職或無給職，國安會拐個彎列聘用要點，核發祕書長月薪30萬，這等於五院院長級的薪水，諮詢委員19萬比部長月薪17萬還高，一年人事費要2200萬。
國安會秘書長袁健生：「諮詢委員不是9點鐘才上班，是6點就上班。」立委尤美女：「沒有通過三讀前，他們仍然是黑機關、沒有法源。」袁健生：「這是政院有核定。」
新任的國安會秘書長袁健生，為了底下諮委給薪法源也很頭大，副秘書長楊永明、從立委跑道轉戰國安會諮委的李嘉進等人，通通捲入這起黑官爭議，然而起因於民進黨政府時，邱義仁擔任國安會祕書長。
時任國安會秘書長邱義仁(2004.3.19)：「可能嗎，呵。」
當時邱義仁薪水被國民黨立委砍成部長級，現在藍軍執政要恢復院長級薪水，民進黨當然不從，「政務人員俸給條例」草案也就一直卡在立院，政府方面希望朝野溝通停止內耗，別讓總統國安智囊團，成為高薪無法源的黑官。
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