總統國務機要費怎麼用，成了關注焦點！立委邱毅再度爆料，他說總統府刻意把國務機要費拆成兩半，其中一部份交由總統機要陳鎮慧專門處理。邱毅懷疑，這裡面大有文章，可能被拿去當成了私房錢。因為陳鎮慧和總統關係匪淺，是陳總統最信賴的親信之一。
總統府內，還有誰跟馬永成、林錦昌一樣能隨侍總統左右？看看2千年政黨輪替時，他所任命的機要人員。
18名機要，李前總統安插了兩個，還有副總統，游錫堃人馬，另外有9個，則是陳總統的親信。陳鎮慧這個名字也在其中，可見總統對她的信賴程度，因為她，還曾經擔任過扁呂競選總部的會計主任。
邱毅就質疑，總統的國務機要費用，有一半，是交由陳鎮慧來打理。國民黨立委邱毅：「某一個關鍵的高層人物，下了條子，把其中2500萬領出來，然後交給陳鎮慧，他既管國務機要費是公帳，又管總統跟官邸的私帳，這樣的作法叫做公私不分，叫做國庫通私庫。」
根據邱毅的說法，目前總統府國務機要費用被拆成兩大塊。其中2500萬是公開的，由會計部門作帳。另一個2500萬則是由陳鎮慧負責。
而被認定屬於機密的國務機要費，要由陳慧鎮負責，是不信任總統府會計，怕機密曝光，還是自己人比較好處理，引起質疑。國民黨立委邱毅：「你說有沒有人把這個東西，就當成私房錢？審計部的查帳如果，不能突破這個點，那這個查帳是假的。」
不過，總統府說陳鎮慧只是負責整理單據發票的經手人，而非承辦人，最後一切帳務，還是會交由會計室來處理，會計長一切清楚掌握。
只是總統府的帳務一天沒釐清，外界的質疑聲就一天不會停，現在只能交由審計部釐清真相。
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