總統府國務機要費涉嫌不法，高檢署查黑中心收到告發函後，除了掌握部份作假帳用的君悅飯店發票，但是約談行動還沒展開，陳水扁總統主動表示，願意配合檢方調查。對此承辦的查黑中心表示，歡迎陳總統先以書面表達意見，有必要的話，將進一步傳喚總統。
接手國務機要費弊案1個多星期，目前查黑中心，比對出部分發票有問題，外界認為，首波約談對象是君悅飯店，但還沒發動攻勢，陳水扁總統卻先公開表達，願意配合檢調，親自到案說明。
高檢署發言人張文正：「在檢方做決定之前，我們比較建議，如果總統認為有先前說明的必要，希望總統以一般書面資料來向檢察官陳述意見。」
事實上，包括前總統李登輝，和現任元首陳水扁都有出庭的紀錄。2004年1月，陳水扁總統，因為頭目津貼賄選案，到花蓮地檢署出庭，當時沒有安全隨扈，沒有前導車，跟一般民眾一樣，徒步進入地檢署，沒有特殊待遇。
但近來，陳總統形象低調，就怕約談引起騷動，因此檢方也不排除，給予高規格待遇，到總統官邸。
另外北檢第二辦公室，還有市調處和安和招待所等等，都是很適合的地點，至於是否可能，像日前總統夫人吳淑珍，以身體健康，改在臺大醫院約談都是變數，因為只要當事人和書記官到場，任何地點都有可能。
