總統府高層大搬風，總統府秘書長陳唐山與國安會秘書長邱義仁職務互調，國安局長薛石民轉任總統府戰略顧問，空缺由副局長許惠祐升任，這樣的人事安排，以邱義仁回鍋最受到注意，在野黨預言，陳總統著手戰略佈局，準備在國務機要費案，以及2008政權保衛戰上發動攻勢。
總統府高層人事大地震，國安會秘書長邱義仁回鍋，與總統府秘書長陳唐山位置互調，這樣的職務調整，陳總統究竟葫蘆裡在賣什麼藥？國民黨立委費鴻泰：「國務機要費案，以邱義仁的巧辯、以邱義仁陰狠的程度，我相信可以應付法庭上發生的一切。」
人事安排的近程目標，在野黨指向國務機要費官司，但是邱義仁的功能取向，當然不只法庭攻防，割喉割到斷的名言，在野黨判斷，2008選戰，陳總統準備出招。國民黨立委洪秀柱：「在選舉的時候，這個人是無所不其極的黑手，他把他放進總統府，可能說是為他自己後路著想。」
因應大選戰略部署，更需要情治單位的支援，因此儘管薛石銘號稱扁家軍，仍然比不過政治身段極度柔軟的許惠祐。國民黨立委賴士葆：「可能作的不夠徹底，不夠符合阿扁總統的意，因此被換掉，許惠祐許局長過去的作風，看起來配合度應該會很高。」
因為國務機機要費案而沉潛的陳總統，為了政權保衛戰，重新站回領導中心的制高點。
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