行政院經貿談判辦公室副總談判代表顏慧欣3月12日因病辭世，傳出她生前遭職場霸凌，她的辭呈內容也提及曾提出建言始終未獲採納，反遭嚴厲駁斥，引發討論。有公務員向《TVBS新聞網》爆料，指該辭呈甚至在顏過世後仍未獲批准。然而仔細梳理行政院長卓榮泰的說法，以及行政院發言人李慧芝說明，兩人在顏慧欣請辭的時間點上有出入，若要讓社會信服，政院有必要說清楚。
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李慧芝稱顏慧欣3月初請辭並獲准
時間拉回到3月24日，顏慧欣過世消息曝光，卓榮泰當天在立法院備詢時證實，日前得知顏慧欣有辭意、提出辭呈，後來進一步了解，得知是因為長期工作上壓力以及身體不適，必須離開工作崗位。
李慧芝24日透過新聞稿說明，顏慧欣是行政院非常倚重的經貿專業人才，然而從去年9月下旬，便因身體健康因素請假，卓揆希望顏能夠安心靜養，3月初並向卓揆請辭，卓揆雖惜才，仍因希望能夠讓顏妥善治療勉予准辭。
網友匿名爆經貿辦霸凌 政院：沒聽過
3月26日有網友透過社群平台Threads發文指出，顏慧欣自離開中華經濟研究院加入行政院經貿談判辦公室後，長期承受長官的管理風格所帶來的壓力，該網友表示，顏慧欣在會議中經常因提出不同專業觀點，遭長官當眾否定與斥責；長官要求屬下繞過顏慧欣，直接將公文與資訊呈報給自己，削弱甚至架空她副總談判代表的角色與職責。影射霸凌該名「長官」就是總談判代表楊珍妮。
26日行政院會後記者會上，李慧芝表示，行政院目前正在了解一切相關情形。哽咽提到，顏慧欣的離開，行政院長卓榮泰與副院長鄭麗君都感到非常心痛不捨，尤其非常感謝顏慧欣在美國談判的付出，戮力完成國人交給行政院的使命，值得國人給予最高的肯定，將頒發一等功績獎章，以表彰與感念顏慧欣的卓越貢獻。
卓榮泰稱春節期間收辭職信「第一時間回覆」
3月27日，卓榮泰表示，顏慧欣確實因為個人的因素，包括身體的因素，在今年農曆年的連假當中，用傳真的方式、簡訊的方式，傳來一封她的辭職信，但當時正值連假當中，所以他的辦公室同仁第一時間也回覆，請她能夠好好的珍惜保重身體。至於目前的質疑，行政院必須做出清楚的調查，向社會、顏慧欣及其家屬有一個非常清楚的交代。
27日當天，顏慧欣在2月19日在加護病房寫下的辭職信曝光，內容點出，實際參與行政院貿辦（OTN）的工作後，職心中頗感憂慮。例如過去多次由國家領導人層級對外宣示的爭取加入CPTPP一事，實際上在執行層次充滿消極敷衍的態度，無具體計畫與時程；職在過去一年半多次提出建言，不但未獲採納，甚至遭到嚴厲駁斥。
行政院改口：卓榮泰已指示啟動事實釐清程序
李慧芝昨上午透過新聞稿指出，卓榮泰院長十分重視顏慧欣受排擠議題，已指示啟動事實釐清程序，並依據《公務人員執行職務安全及衛生防護辦法》以及《行政院院本部職場霸凌防治申訴及調查處理要點》等相關規定，將由本院「安全及衛生防護委員會」之外部委員，就相關事實進行必要釐清。
