明年立委併公投的選舉，中選會決議一階段領票，而藍軍執政縣市，堅持二階段投票，台北市選委會甚至強硬表示，「除非陳總統宣布戒嚴，二階段領票的選務不會改變」，不過，行政院隨後開記者會警告，這種做法違法，地方選委會不要以身試法，同樣負責選務的中央與地方，正式開戰。
反對立委併公投，一階段領票，台北市心意已決，中央也很強硬。台北市選委會主委吳秀光：「中央選委會用這種越俎代窇的方式，本來就是以命令來違反法令，它本身就是個無效之舉。」
中選會違反選罷法，以命令代替法律，無效。內政部長李逸洋：「泛藍18個縣市，這樣串聯的抵制違抗，事實上是一種公然違法。」
全國公投由政院主管，18縣市串聯，公然違法，違不違法中央地方各自解讀，重點就在於基層選務人員，到底該聽中央還是地方的指揮。法務部長施茂林：「公務員對兩級長官所發布的命令，以(遵從)上級長官為主。」
台北市選委會主委吳秀光：「除非陳水扁宣布戒嚴，這個社會、這個法令，並不是他說了算。」
究竟一階段兩階段兩種制度差在哪裡？中選會決議的一階段投領票，投票人分別在立委與公投票領票區，一次領完政黨票立委票，以及藍綠陣營，各一張公投票，到圈選處圈選，最後到投票匭投票，而藍營18縣市屬意的兩階段投領票，是先領完立委、政黨2張票，圈選投票後，如果要投公投票，再繼續到公投領票區，領取選票。
只是選務喬不攏，如果泛藍執政縣市，真的採二階段領票，這選票還算數嗎？中選會主委張政雄：「到底(二階段投票)是不是有效，還是無效，這個是要看到時候發生的情形。」
選務爭論不休，引用的法條也不同，再不解決，明年的選務恐怕真的會出現荒謬的，一個選舉兩種制度。
